Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC6Q96NY7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms