Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK3Q96L96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK3Q96L96 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms