Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms