Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms