Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR1Q96JP9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms