Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms