Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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