Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39LQ96EH5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms