Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms