Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD1AQ96CP6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms