Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPRTQ96BW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPRTQ96BW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms