Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms