Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms