Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRAT1Q92837 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms