Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6NLQ92738 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6NLQ92738 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms