Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTTNBP2Q8WZ74 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms