Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TRIM41Q8WV44 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms