Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3LQ8TDB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms