Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms