Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A5Q8NCS7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms