Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms