Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8N8P6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N8P6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N8P6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N8P6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms