Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms