Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC47Q8N1G4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC47Q8N1G4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC47Q8N1G4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC47Q8N1G4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
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