Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE1Q8N0S2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms