Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
P3H3Q8IVL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
P3H3Q8IVL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
P3H3Q8IVL6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms