Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD6

RNF135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF135Q8IUD6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF135Q8IUD6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF135Q8IUD6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms