Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DZIP3Q86Y13 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms