Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMC1Q7Z7K0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms