Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC4Q7Z404 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC4Q7Z404 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms