Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP54Q7Z3B4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms