Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED13LQ71F56 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED13LQ71F56 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms