Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms