Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms