Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms