Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms