Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC4Q6P2E9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EDC4Q6P2E9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms