Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1Q6P1K2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms