Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD2Q6NTF9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms