Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA1Q5VX52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms