Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCERG1LQ5VWI1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCERG1LQ5VWI1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms