Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms