Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms