Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM201Q5SNT2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms