Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XKR3Q5GH77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms