Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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