Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms