Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms