Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLPPQ16740 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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