Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TNXAQ16473 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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TNXAQ16473 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TNXAQ16473 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TNXAQ16473 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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